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2 测序圈又杀出一匹黑马?罗氏SBX技术能上桌吃饭吗?

22 mars 2025 · 35 min

Notes de l’épisode

2025年2月20日,罗氏发布了全新测序技术SBX(Sequencing by Expansion),引发业界关注。SBX发布会上宣传的测序准确性达到Q39令人震惊,但这究竟是技术革命还是虚张声势?本期节目中,新主播小泽和小羊将带你深入解析SBX测序技术的核心创新、亮点和潜在局限,探讨其在学界和业界的应用前景。

时间轴:

00:00 – SBX测序技术来了!

小羊和新主播小泽带你聚焦罗氏SBX测序技术!

03:12 – 罗氏的测序执念:一路的收购与尝试

从454测序技术到最新的SBX技术,罗氏十几年在测序领域屡次尝试与挣扎背后的故事。

05:06 – 纳米孔技术 vs. Illumina:测序到底怎么测?

详细解读纳米孔测序与illlumina测序技术的根本区别,以及Roche副总裁“我们高效测序DNA的办法是不测序DNA”的神秘含义。

07:09 – 什么是Xpandomer?罗氏的技术秘密武器

深度剖析SBX的核心Xpandomer技术如何实现信号增强,让测序更清晰、更高效。

08:45 - SBX是纳米孔测序,但是为什么测不长?

作为纳米孔测序的SBX,为什么最终的测序长度止步在一两千?

10:25 – SBX的技术优势在哪里?

从“flexible operation”,到惊人的高通量和高准确度,小泽为你深度解读SBX的多维优势。

21:21 – SBX听起来很厉害,但它有哪些局限?

新技术固然诱人,但价格未知加上技术的潜在局限,让想上桌吃饭的SBX面临挑战。

27:49 – 学术界和工业界,谁更适合SBX?

SBX能否真正挑战Illumina的江湖地位?小泽和小羊从各自领域的角度展开探讨。

33:36 – 总结与展望:SBX的未来值得期待吗?

SBX带来了短读长测序的新方案,尽管前景光明,但最终影响力还得看价格。

参考资料:

  • 纳米孔读Xpandomer得到的清晰到肉眼可做basecalling的电信号(so crazyyyyyy。。。):
  • 大家一起来学习一下大佬名言:
    "Our approach to efficiently sequencing DNA is to not sequence DNA." -- Mark Kokoris, Vice President, Head of SBX Technology at Roche Diagnostics Seattle.

关于我们:

小羊 - 生物科技公司生信岗打工人,专注于肿瘤精准医疗。什么都想学一学,想要成为生活杂家,攀岩烘焙修炼中。Alex - 计算机生物PhD在读,梦想成为生命探险家,过有趣的一生。小泽 - 非典型生物物理学博士生,从力学跳槽到生物,身体力行成为了无知者无畏的真实写照😅,目前专注单细胞测序相关技术开发。
在小宇宙查看该单集文稿

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